We Włocławku w 1593 r. zatrzymał się król Zygmunt III Waza, który podróżował Wisłą do Szwecji, a którego podejmował bp Hieronim Rozrażewski. Po zawarciu pokoju ze Szwecją w Oliwie zatrzymał się 13 maja 1660 r. we Włocławku król Jan Kazimierz, podejmowany przez bp. Kazimierza Charbickiego.
Czterokrotny najazd wojsk szwedzkich, saskich, rosyjskich i „zaraza morowa” w 1708 r. doprowadziły miasto do prawie całkowitego upadku.
Od 1 lutego do 20 maja 1790 r., z polecenia Komisji Wojskowej przebywał we Włocławku gen. Tadeusz Kościuszko. W 100. rocznicę śmierci T. Kościuszki mieszkańcy miasta ufundowali w 1917 r. tablicę w kościele św. Jana Chrzciciela.
W okresie zaborów Włocławek odwiedził w 1794 r. król pruski Fryderyk Wilhelm II: miasto w 1793 r. znalazło się pod hegemonią Prus i przestało być własnością biskupów kujawsko-pomorskich.
5 czerwca 1817 r. przebywał tu sekretarz Królestwa Kongresowego Julian Ursyn Niemcewicz, podejmowany przez Kapitułę Katedralną, który odwiedził też Płowce. W 1819 r. przybył do Włocławka namiestnik Królestwa, gen. Józef Zajączek. Przejazdem, dwa razy, w 1823 i 1825 r. zatrzymał się w mieście car Aleksander I.
W wolnej Polsce odwiedzili miasto: 16 października 1921 r. Ignacy Daszyński (wygłosił odczyt na wiecu robotniczym na tematy społeczno-gospodarcze), 28 października 1923 r. prezydent Stanisław Wojciechowski i 12 lipca 1928 r. prezydent Ignacy Mościcki.
Bezpośrednim powodem przyjazdu prezydenta S. Wojciechowskiego do Włocławka było wręczenie sztandaru stacjonującemu tu XIV Pułkowi Piechoty. Przybyłego pociągiem o godz. 11.00 prezydenta powitała na dworcu młodzież i ludność miasta oraz władze cywilne i kościelne. Bezpośrednio z dworca prezydent udał się do katedry, gdzie odprawiona została cicha Msza św. pontyfikalna, po której bp Stanisław Zdzitowiecki poświęcił sztandar ofiarowany XIV Pułkowi przez Włocławek i Kujawy. Po południu prezydent złożył wieniec na mogile Obrońców Włocławka z 1920 r.
Prezydent Ignacy Mościcki przybył do Włocławka na zaproszenie Okręgowego Kujawskiego Towarzystwa Rolniczego. W katedrze został powitany zgodnie z ceremoniałem liturgicznym przez duchowieństwo i ordynariusza diecezji włocławskiej, bp. Władysława Krynickiego.
Włocławek miał również zaszczyt powitać pierwszego od czasów porozbiorowych przedstawiciela Stolicy Apostolskiej - Achille Rattiego, który jadąc z Berlina do Warszawy, zatrzymał się w tym mieście 29 maja 1918 r. i był witany przez biskupa, duchowieństwo i wiernych diecezji kujawsko-kaliskiej. Drugi raz Wizytator Apostolski przebywał we Włocławku we wrześniu 1918 r.
22 września 1918 r. Achille Ratti odprawił uroczystą Sumę w katedrze i udzielił diecezji apostolskiego błogosławieństwa. Rok później, 28 października 1919 r. otrzymał święcenia biskupie z rąk abp. Aleksandra Kakowskiego, a jednym ze współkonsekratorów był bp S. Zdzitowiecki. 6 lutego 1922 r. wybrany został papieżem i przyjął imię Piusa XI. Na pamiątkę pobytu Administratora Apostolskiego we Włocławku wmurowano w 1929 r. na zewnętrznej stronie katedry od strony północnej tablicę ku czci papieża Piusa XI, a 30 sierpnia 1936 r. przemianowano ulicę Gdańską na ulicę Piusa XI.
Na zaproszenie Związku Pracy Obywatelskiej Kobiet gościli w 1932 r. pisarze: Zofia Nałkowska i Leopold Staff i dwukrotnie w 1933 i 1938 r. Gustaw Morcinek. W 1934 r. na zaproszenie dyrektora Gimnazjum im. M. Konopnickiej Zofii Degen-Ślósarskiej przebywali: Jan Sztaudynger i Kazimiera Iłłakowiczówna.
We Włocławku gościli: kard. A. Kakowski, arcybiskup obrządku ormiańskiego Józef Teodorowicz (2 razy) oraz prymasi polscy: Edmund Dalbor w 1918 r., August Hlond w 1935 i w 1937 r., wielokrotnie Stefan Wyszyński i obecny prymas Józef Glemp.
25 września 1937 r. w uroczystości otwarcia i poświęcenia nowego mostu na Wiśle swojego imienia wziął udział marszałek Edward Rydz-Śmigły, któremu towarzyszył minister komunikacji Juliusz Urlich. (Pierwszy most zbudowano w 1865 r.). Po Mszy św. w katedrze wszyscy uczestnicy udali się na nowy most, gdzie po okolicznościowych przemówieniach marszałek E. Rydz-Śmigły przeciął wstęgę, a bp Karol Radoński dokonał poświęcenia mostu, przechodząc wraz zebranymi gośćmi przez całą jego długość. Wieczorem w sali Rady Miejskiej wręczono marszałkowi Polski dyplom honorowego obywatelstwa miasta Włocławka.
W dniach 6-8 września 1938 r. bp K. Radoński podejmował we Włocławku nuncjusza apostolskiego F. Cortesiego.
Po zakończeniu II wojny światowej, 15 i 16 czerwca 1947 r. przebywał we Włocławku kard. Bernard Griffin z Londynu. W powitaniu angielskiego prymasa udział wzięły rzesze wiernych oraz przedstawiciele władz miejskich.
W uroczystościach 1000-lecia chrztu Polski w 1966 r., obchodzonych również we Włocławku, udział wziął kard. Karol Wojtyła.
W III Rzeczpospolitej przebywali w tym mieście prezydenci: Lech Wałęsa i Aleksander Kwaśniewski oraz kardynałowie Kurii Rzymskiej.
Największego zaszczytu dostąpił Włocławek 6 czerwca 1991 r., kiedy miasto nawiedził Papież Jan Paweł II, odbywający pielgrzymkę do Ojczyzny pod hasłem: „Bogu dziękujcie, Ducha nie gaście”. We Włocławku Ojciec Święty spotkał się z nauczycielami i katechetami, o czym przypomina pamiątkowa tablica przy wejściu do katedry.
Warto zauważyć, że jeśli Włocławek odegrał ważną rolę nie tylko kościelną, ale i polityczną w dziejach narodu i państwa, to ze względu na fakt, że od najdawniejszych czasów był stolicą biskupstwa. Miasto korzystało z opieki biskupów włocławskich, którzy troszczyli się nie tylko o rozwój gospodarczy i kulturalny, prowadząc szkoły i sprawując opiekę nad najuboższymi, ale także bronili jego mieszkańców przed wyzyskiem szlachty i innych krzywdzicieli. Dziś miasto to, mimo swej prowincjonalności, jest znaczącym ośrodkiem teologicznym w Polsce.