Kard. Stanisław Dziwisz, na skutek licznych listów wiernych zaniepokojonych wystąpieniami ks. Piotra Natanka, powołał 3 lipca 2009 r. komisję teologiczną, której zadaniem było dokonanie oceny teologicznej treści publicznie przez niego głoszonych. W związku z negatywną opinią i na podstawie wizytacji kanonicznej w jego ośrodku w Grzechyni Metropolita Krakowski ograniczył ks. Natankowi możliwości działania duszpasterskiego. Nakazał m.in. zaprzestania działalności duszpasterskiej prowadzonej w Grzechyni oraz zabronił publicznych wystąpień i rozpowszechniania w jakiejkolwiek formie zarówno nowych, jak i archiwalnych wystąpień duszpasterza. Ks. Natanek nie posłuchał. Poddał natomiast krytyce pracę komisji teologicznej. W efekcie takiego zachowania 23 maja 2011 r., Metropolita Krakowski z biskupami pomocniczymi wydał „Oświadczenie w sprawie działalności ks. Piotra Natanka”, w którym biskupi stwierdzili, że włączanie się w działania ks. Natanka „może prowadzić do rozbicia kościelnej jedności, a nawet do oderwania się od wspólnoty wierzących”.
31 lipca 2011 r. ks. Natanek ogłosił wprowadzenie w swoim ośrodku święta Dwojga Serc - Najświętszego Serca Pana Jezusa i Matki Bożej, którego podstawą są m.in. prywatne objawienia Vassuli Ryden - Kongregacja Nauki Wiary pod przewodnictwem kard. Josepha Ratzingera, obecnego papieża Benedykta XVI, uznała je za błędne teologicznie.
20 lipca 2011 r. kard. Dziwisz nałożył na ks. Natanka karę suspensy, która zabrania mu sprawowania jakichkolwiek funkcji kapłańskich. W odpowiedzi ks. Natanek publicznie wypowiedział posłuszeństwo swemu biskupowi, które uzasadnił m.in. przekonaniem o jego kontaktach z masonerią.

(K. W.)